装卸自然吨是指进、出港区并经装卸的货物数量。一吨货物从进港至出港(包括陆进陆出，水进水出，或只进不出，只出不进的物资，以及用于本港消耗的建港物资等)，不论经过几次操作，均只计算为一个装卸自然吨。在计算装卸自然吨时，除进港后不再出港或在港区消耗的建港物资等是在进港时统计外，其余一律于装船或装车出港时统计，这可以促进港口不只重视卸货，而且更重视装货，有利于提早实现商品的使用价值，也有利于减少货物在库场的积压，保持港口的通畅。

自然吨与吞吐量之间的最大区别，在于水水中转货物在港口进行换装作业时，每一个装卸自然吨计算为两个吞吐吨，而水陆中转则统计为一个吞吐吨。

装卸自然吨是核算港口装卸成本的依据，也是计算操作系数的基数。

吞吐量=装卸自然吨÷(2﹣α)

式中：α——水陆换装自然吨与总自然吨之比^[1]